Можно ли извещение о приостановленнии лицензии отправить в налоговую инспекцию через ящик данных/datovou schránku?

Да, это возможно. Необходимо заполнить электронный формуляр «Oznámení o změně registračních údajů», раздел 2, строка 11. Правильно выполненый формуляр отправить через datovou schránku. Подписывать ничего не придеться, т.к. отправка через datovou schránku равносильна подписанию документа собственноручно.

Советую Вам также известить Živnostenský úřad о приостановлении предпринимательской деятельности. Для этого необходимо заполнить и отправить «Změnový list».